上午7点到8点→内环线21部，外环线19部
上午8点到9点→内环线23部，外环线24部
上午9点到10点→内环线21部，外环线22部
内环线和外环线在三个小时内总共发出了六十五部列车。
按照定员人数计算，三小时内电车运送的乘客总数是：（内环线2900人+外环线3500人）×65——
可是，截至1月3日，日本总人口已经减少了百分之十五；而根据都市交通调查的数据，占都市区乘客约三成的学生还在放假——将这些因素考虑在内，上述计算结果还应该乘以0.85，再乘以0.7——
1月4日早晨三小时上班高峰期一同消失的乘客数大概有二十四万七千五百二十人。
但总数远不止于此。
并非只有山手线上的乘客消失。消失也不仅限于首都圈。首都圈、京阪神（注：京都、大阪、神户的统称。）、名古屋、福冈、札幌——所谓“五大都市区”——在1月4日早上的三小时上班高峰期内，有多条铁路线上的乘客消失了。
经确认，发生消失事件的有以下线路：
◎首都圈
JR山手线、中央线、埼京线、总武本线
◎京阪神
JR大阪环状线
大阪市营地铁御堂筋线
神户市营地铁西神山手线
京都市营地铁铁乌丸线
◎名古屋都市区
名古屋市营地铁名城线
名古屋市营地铁东山线
名古屋市营地铁鹤舞线
名古屋市营地铁樱通线
◎福冈都市区
JR鹿儿岛本线、日丰本线
西日本铁路天神大牟田线
福冈市营地铁空港线
福冈市营地铁箱崎线
福冈市营地铁七隈线
◎札幌都市区
札幌市营地铁南北线
札幌市营地铁东西线
札幌市营地铁东丰线
1月4日早晨，上述线路上班高峰期的所有乘客一同消失了。消失事件不止发生在这一天，之后其他线路上也开始有乘客消失。
1月5日早上上班高峰期，东海道新干线、山阳新干线和九州新干线的乘客全部消失。
可以想见，犯罪集团是利用东京、名古屋、大阪、博多的新干线的总合车辆所（车库）让乘客消失的，其手法与山手线上的消失事件如出一辙。
同日，札幌都市区的JR北海道函馆本线和千岁本线上的乘客全部消失。
1月6日早晨上班高峰期，从东京出发、经过名古屋、开往京阪神的JR东海道本线上的所有电车的乘客都消失了；首都圈的JR总武线和东京地铁千代田线、半藏门线、东西线、有乐町线，以及东急（注：“东京急行电铁”的简称，日本民营铁路之一，下文的“小田急”也是。）田园都市线上所有电车的乘客也全部消失。
此外，今天——即1月7日——首都圈的JR京浜东北线、小田急小田原线、京王线、东武东上线、东急东横线，阪神的私铁阪急、阪神、近铁各线路，名古屋的私铁名铁、近铁成为袭击目标，上班高峰期的乘客全部消失。
北海道和福冈6日的受害情况尚未确认，但犯罪集团似乎在一天内做了转移，1月7日，仙台和广岛也发生了乘客消失事件。
仙台和广岛遇袭后，日本七大都市区中的铁路乘客都在不断消失。
警察总部占领事件和持续增加的失踪事件让媒体疲于奔命，乘坐电车危险的警告只在互联网发布，所以大量毫无防备的普通民众消失了。
面对这样的危机，即使是应变能力超强的特工也大量消失。
截至1月3日夜，北野和川北等潜伏在日本的某国特工，还有百分之八十五——即一万七千人——平安无事。